芽孢杆菌在水产养殖中的作用：水质改良、抑制致病菌、 增强水产动物的免疫力、促进水产动物的生长，提高耳料利用。
1、水质改良。
芽孢杆菌具有很强的分解有机物、氨氮、亚硝酸盐,而且能分泌胞外酶分解养殖水中的粪便和残饵。对水质的和底质具有很好的改良效果。虾苗培育后期经常用芽孢杆菌和沸石粉一起改善水质。
2、抑制致病菌。
芽孢杆菌在水体中一旦占据优势就会抑制有害菌的生长。而且进入动物肠道以后可以抑制致病菌使肠道PH值下降，并且大量耗氧使肠道维持厌氧环境起到控制致病菌的作用。
3、增强水产动物的免疫力。
定期使用可以保持水质的菌相，抑制有害菌生长。保持水质稳定和水产动物的正常生长。
4、促进水产动物的生长，提高耳料利用。
芽孢杆菌在水产动物的肠道繁殖会产生维生素、氨基酸、有机酸等参与动物的新陈代谢促进生长。
水产养殖中，使用水产EM菌可改善水质、促进生物多样性，增强养殖生态系统稳定性。使用方法包括：
1.菌种培养：将EM菌种加入有机物质，培养出浓度适宜的发酵液，作为菌源。
2.施用水体：将EM发酵液均匀撒入养殖水体，可分次投放，逐步增加用量，避免冲击。
3.定期施用：每周投放1-2次，根据水体状况调整频率与用量。
4.环境调理：结合生态需求，使用EM菌调节水体pH值、氨氮等指标，维持水体平衡。
5.应用于饲料：将EM菌与饲料混合，促进消化吸收，增强鱼虾等生长。
6.联合应用：可与其他有益菌剂、生态调理剂搭配使用，协同效果更佳。
