一，幼苗期。芝麻幼苗期，可少量施提苗肥，以稀释腐熟的动物粪便或尿素效果较好。不宜施氮肥过多，否则易使幼苗旺长，成为高脚苗。幼苗初期施肥时因芝麻根系浅应尽量浅施。苗期追肥宜开沟条施为好，如果土壤肥沃，基肥足，苗期也可不追肥。
二，花蕾期。此时是花芽分化形成时期，芝麻生长需要营养较多，此时应及时追肥，以氮肥为主，磷肥、钾肥为辅。根据土壤情况适量施加硼肥。追肥应1-2次为宜，时间宜早不宜迟，可亩施尿素3-4公斤，或硫酸铵15-25公斤，或人畜尿粪1500-2000公斤。
三，花期。芝麻进入花期会迅速生长，此时吸收的营养占整个生育期的70%-80%，因此此时必须进行追肥，此时芝麻根系发达，侧根大量生长，施肥以化肥较方便，也可施用腐熟的饼肥、粪肥等。可施硫酸铵、过磷酸钙各8公斤，可增产3成。时机宜早不宜迟，不可晚于盛花期，否则遇雨季阴雨天气易造成贪青晚熟，加重病害。芝麻追肥宜结合中耕，培土，浇水等时机进行。另在始花期和盛花期，可叶面喷施硼磷钾肥，也可明显提高产量。
另外，在芝麻种植前期，做好基肥也很关键。以亩产150斤芝麻为例，基肥可施农家肥1500公斤，过磷酸钙20公斤，硫酸钾或氯化钾3-5公斤，尿素2-3公斤。若想提高亩产量，则相应根据此比例适当增加肥量。
一要施足基肥，每亩施农家肥1500千克。在长出3～4真叶后，施1～2次人粪尿，开花结蒴期是芝麻生长最旺盛时期，也是需肥高峰期，每亩追施硫酸铵10～15千克，并用0.4%的磷酸二氢钾与0.2%的硼砂混合溶液进行叶面喷施；
5～7天喷一次，连喷2次。
