酵母菌在畜牧业中的应用是随着对其认识的加深而不断拓宽和深入的。早在20世纪2O年代，Eckles等(1925)尝试将其用作泌乳牛的蛋白质补充饲料应用于牛的养殖。随后，史上一波又一波的蛋白质匮乏带来了一次次的养殖业恐慌，这更加深了对酵母菌的重视。酵母菌逐渐成为一种廉价而优质的蛋白质来源。
20年代中后期生物技术飞速发展，对酵母菌的营养及保健功能的研究和利用不断加深。
酵母菌在其培养环境中生长繁殖，不仅使自身菌体体积增大、数量增加，从而使其能提供的营养素增加，而且在底物的发酵过程中还可生成大量发酵产物。这时的发酵体系中除了酵母菌。还包含成分极为复杂的复合发酵产物。酵母菌在不同的培养环境下，如：不同的温度、湿度或酸碱环境尤其是底物成分，会产生不同的发酵产物，而这其中又包含大量的未知生长因子。虽然大多数未知生长因子的作用机制尚未透彻，但它们对畜禽及水产动物的生长和生产性能影响巨大。
酵母菌和霉菌在畜牧业生产中应用广乏，生产飼料，生产畜药等。
