对于沼液过滤，一般采用沉淀池多级过滤。将修建好的沉淀池相邻池子之间用不同目数的筛网链接，例如：20目—80目—120目。最后将沼液引入到灌溉系统中，按照常规用水进行过滤。还可以采用砂石过滤器组和叠片过滤器组进行组合，直接将沼液进行过滤。 此外，对于沼液过滤中还应注意，沼液对于过滤器管道的腐蚀，最好选用PE材质。同时对于部分沼液中可能重金属超标，还应安装重金属离子分离器。据了解，将沼液引入到农业种植体系中不但可以利用沼液达到废弃物的循环利用，防止因为沼液排放造成的面源污染，而且可提高作物种植中水分、养分的利用，提高作物产量和销售收入。
另外，由于沼液养分的利用，可减少有机肥和化肥投入，具有显著的经济效益和社会效益。
