钵土要有养分。钵土养分的多少和营养成分是否齐全，不仅影响到棉苗素质，同时也影响到移栽后的生育进程。要选择无枯萎病、黄萎病和无盐碱成分的肥沃表层熟土，冬前开始备土，立春后提前施肥，这样能使土壤充分熟化细碎。
为确保营养钵有丰富的营养，应施足有机肥和磷钾肥，有机肥以经过充分腐熟的人畜粪或厩肥为最好。一般每亩床土施过筛的厩肥250～500千克或人畜粪200～400千克，过磷酸钙、氯化钾各15～25千克，腐熟饼肥25～50千克，有机肥料和化肥与表层熟土混合搅匀，肥、土的配合比例为1∶4～5。切实做到有机肥与无机肥，速效肥与迟效肥相结合，氮、磷、钾相配合。据研究报道，钵土的肥力指标一般以有机质含量在1.5%以上，全氮0.1%以上，速效氮100毫克/千克，速效磷30毫克/千克以上为宜。
氮素化肥作基肥宜在制钵前施用并浅翻，切忌面施接触种子，以免影响棉子的发芽和出苗，其中尤其以尿素最突出。尿素是一种高浓度的氮素化肥。施入土壤后被土壤微生物分解形成碳酸铵或重碳酸铵，碳酸铵再经水解作用变成氨及碳酸，而氨易气化逸散，在尿素颗粒溶化处，常出现pH高达9～11的强碱及氨浓度高的环境，形成高氨强碱区，且亚硝酸态氮含量也相应提高。若种子进入这个区域就会造成根尖坏死，主根不能下伸，下胚轴也难以伸长，造成棉苗盘曲，不能正常发芽和出苗，鉴于广大棉农常拿尿素作苗床基肥施用，为此，必须强调提出：尿素不宜作苗床基肥施用。
