因其草食性、生长快、肉质鲜美等特点，是优良的淡水养殖品种。
中国具有悠久的草鱼养殖历史，但迄今为止草鱼在中国尚未形成人工选育的优良品系，这是由于草鱼的繁殖周期过长、亲鱼个体大等特殊原因造成的。几乎所有的草鱼养殖场面临着有效繁殖群体过小、近亲交配、逆向选择等问题。人工繁殖的草鱼苗种由于亲本的多代近亲交配，已出现严重退化现象如性成熟提早、个体变小、抗病能力差等【卜引，导致草鱼的经济性状衰退和基因库的萎缩，这些问题严重制约了草鱼养殖的进一步发展。在野生草鱼的遗传资源中，可能隐藏着大量的抗病基因、促生长基因、抗逆基因等。如何在比较草鱼野生群体和人工繁殖群体问遗传结构差异的基础上，寻找这些与生长、抗病、抗逆相关的基因，解决草鱼养殖性状退化的问题是水产养殖业当前迫切需要解决的问题。
