贵阳农投集团下属全资子企业15家，控股企业1家，参股企业12家。分别为：全资企业：贵州南方乳业有限公司；
贵阳三联乳业有限公司；
贵州省清镇农牧场生态发展有限公司；
贵州省红枫湖畜禽水产有限公司；
贵阳市惠民民生农副产品经营有限公司；
贵阳市粮食发展(集团)有限公司；
贵阳农投创业投资有限公司；
贵阳市蔬菜有限责任公司；
贵阳市扶贫开发投资有限公司；
贵州海科实业发展有限公司；
贵阳市农业机械有限公司；
贵阳市菌菇产业发展有限公司；
贵州省贵阳中药现代化高新技术创业服务中心；
贵阳农产品加工园区开发建设有限公司；
贵州惠黔股份投资中心(有限合伙)。
控股企业：贵州金农基金管理有限公司。
参股企业：贵阳农产品物流发展有限公司；
贵阳市奶品供应有限公司；
贵阳市医疗健康产业投资股份有限公司；
贵阳驹马惠民物流有限公司；
贵州农链网络科技有限公司；
贵州贵农正丰现代农业有限公司；
贵州蔬菜集团有限公司；
贵阳市联众优品生物萃取有限公司；
贵阳金地农业开发投资有限公司；
贵州省农村资源资产权益交易中心有限责任公司；
贵州绿色产业扶贫投资基金(有限合伙)；
贵阳农投贵银农业产业发展基金合伙企业(有限合伙)。
