1、严格控制污染物排放总量，继续削减工业污染，对钢铁、电力、化工、煤炭等重点污染行业推广废水循环闭路的零排放制度，切实加强对污染排放单位的审核和监督。
2、加快建设节水型工业和节水型社会。进一步研究工业节水管理办法，规范企业节水范围，对水污染重点排放行业严格执行用水定额和节水标准。
3、大力推进城市污水处理与资源化。从根本上避免城市水环境继续恶化，另外还要完善城市排水系统，提高城市污水处理的技术水平。
缺水城市在规划污水处理设施的同时要安排回用设施的建设，开展污水处理的深度处理。
4、发展生态农业和有机农业，综合防治面源污染。今后主要推广有机肥，制定农药、化肥的减量计划，切实解决农业面源污染问题。
5、采取措施切实保护海洋生态环境。
6、科学合理地调配水资源，保证生态用水。开发利用水资源应以保护水环境功能为前提，兼顾水资源上、下流域的需求，要按照水资源可开发总量来发放许可证。
7、要优先保护饮用水源地水质。要制定全国城市和农村饮用水源地的保护规定，在水源地保护区内严格限制各种开发活动。
8、要严格控制持久性有机污染物。中国农药的大量使用使得水体中持久性的有机污染物比例较高，对此要严格控制。
