划分依据主要有以下几点：
一是与各类规划相结合。永久基本农田的划定要科学结合国民经济和社会发展规划、土地利用总体规划、城乡建设规划、农业发展规划、生态环境建设规划、基本农田专项规划等规划成果，在各类规划协调统一的基础上划定永久基本农田范围，使其能得以长久保护。
二是与农用地分等定级的成果以及第二次土地调查的数据相结合。划定永久基本农田必须根据农用地分等定级的成果，将高等优级的耕地划入，同时利用第二次土地调查成果，在精准地籍的基础上划定永久基本农田，使永久基本农田落位准确，方便管理。
三是与土地整理项目相结合。土地整理项目的实施是国家投入较大的资金对田、水、路、林、村的全面改造，使整理的耕地达到优质高产良田的标准。因此经过土地整理的耕地须优先划入永久基本农田。等等
