雨水能直接冲刷掉药剂，造成流失，这样除要影响杀虫、杀菌和除草的效果外，还会造成污染河流、水域，以致发生水生动物中毒死亡的事故。
因此，在阴天或快要下雨的天气里，切不可施用农药。然而，不同的农药品种和剂型对雨水的冲刷能力也有所不同，如敌百虫抗雨水冲刷性差些，而乐果、久效磷、三唑酮、多菌灵等，由于它们具有内吸作用，药剂能被植物吸收到体内，雨水对它们的影响就要小了。
在剂型中，以粉剂和可湿性粉剂最不耐雨水冲刷，容易流失，而乳油农药由于在植物上能形成一层油膜，对雨水冲刷有一定的抵抗力，但也有一定的限度。
