大棚内灌溉应顾及到早春或深冬棚内保持地温、降低棚内空气湿度和减轻病害发生。常用的灌溉方法有：沟灌、膜下软管滴灌、自动喷灌和滴灌等。
沟灌。是将水或水泵抽上来的水通过水渠或水管灌入畦沟或垄沟中，冬季为避免湿气过大，以地膜下沟灌为多，方法简易，成本低，但耗水量大，土壤易板结，缺水或粘土区不宜采用。
膜下软管滴灌。是在直径 20 ～ 40 毫米无毒聚氯乙烯薄膜管上，每 15 ～ 40 厘米开两排直径为 0.6 ～ 1.0 毫米的小孔，将这种软管小孔朝上放畦面上。一端接在主管道上，另一端用堵头封死，然后畦面覆上地膜即成，优点是省水、省力，节能、不易使土壤板结，便于自动化，主要缺点要求水质高，易堵塞。目前由中国农业工程研究院设计，美地源生产的软滴灌系统已大面积推广应用。
自动喷灌系统。在大棚顶端悬挂多孔塑料管，每隔 l 米安装一个喷嘴 ( 可喷 3 ． 2 米圆径 ) ，每喷雾 10 分钟相当于一次中雨的水量，可自动控制，但易造成棚内湿度大。
滴灌法。在硬质塑料管上安装细小的半硬质塑料管，
每株作物根际插一小管，用每平方米 0.2 ～ 0.5 千克的低压向多孔硬质管供水，通过水管滴入根际土壤中，此法比软滴灌费用大，存在同样缺点。
此外，还有地下渗灌等，近年从以色列引进的滴灌系统和双壁滴灌软管，性能很好，正在引进消化实现国产化中。
