杀菌剂种类比较多，基本上分为三类：
细菌性：多为铜制剂、抗菌素(井冈、多杀、多抗除外)，如：氢氧化铜、农用链霉素、中生菌素、可杀得、噻菌铜、喹啉铜、噻唑锌、春雷.王铜、氯溴异氰尿酸、乙蒜素等。
病毒病：如阿泰灵、毒氟磷、氨基寡糖素、香菇多糖、盐酸吗啉胍·乙酸铜、病毒A、植病灵、四霉素等。
真菌性：凡是能用于防治作物霜霉、疫病、灰霉、炭疽、白粉、黑粉、锈病及非细菌性叶斑病的多数是真菌杀菌剂。
辣椒青枯病属于细菌性病害，预防为主。可以用链霉素，叶枯唑，辛菌胺，中生菌素，噻菌铜，噻森铜，喹啉铜，氯溴异氰尿酸， 多粘类芽孢杆菌 交替或者混合使用加生根剂灌根。
辣椒根腐病，用甲霜.恶霉灵加五氯.福美双或者四霉素或者咯菌腈或者枯草芽孢杆菌 或者多粘类芽孢杆菌 加生根剂灌根，间隔5天连续喷施一次。
