采用人工清粪，猪舍内的猪粪利用人工清运到封闭粪场，猪尿及少量冲舍粪水流入污水处理系统，进入初沉池，沉去细小的悬浮物，粪渣与猪舍内人工清运的粪渣直接运到粪场。这种方法虽然增加了人工费，但每天用水量可大大减少，一般可比“水冲粪法”减少三分之二；排出污水的COD值只有前法的75%左右，BOD值只有前法的40-50%，SS只有前法的50-70%，污水更容易处理；污水池的投资少，占地面积小，日常维持费用低。
对一个万头肉猪的猪场来说，干清粪法比水冲粪法平均每天可减少排污水量100吨左右，年减少污水36500吨。
根据养猪场污水水质特性及排水状况，在污水处理工艺前端设置固液分离段，以利粪便与污水初步分离，减少污水处理量。分离后的粪便和人工清除的粪便作堆积发酵处理后，加工成为有机肥出售。
分离后的污水自流进入沉沙池、调节池，污水经沉淀、酸化及均衡调节后，清除部分水解污泥至污泥干化池。污水经泵提升后进入折流式厌氧反应池（ABR），进行第一级生化处理，产生沼气用于发电、食堂饮事、供热等。沉淀污泥经污泥干化池干化后，送堆肥场和人工清除的粪便一起堆积发酵，作复合肥利用。
经折流式厌氧池（ABR）处理后，粪污水COD、BOD降解大约可达80%以上。污水经中间调节池再进入溪流氧化沟，作好氧深度处理（即二级生化处理），污水在此处进一步脱磷、脱氨处理后，主要降解指标COD、BOD、NH3-N去除率可超过97%以上，基本满足排放标准。处理后污水经集水沉淀池后达标外排。
由于折流式厌氧池（ABR）的运行管理比升流式厌氧池（UASB）简单，对高悬浮固体废水的适应性比较强，没有三相分离器，工程投资较省，所以在这里我们选用折流式池型取代升流式池型。
猪业污染已成为突出的环境问题，地下水和地面水体受到不同程度污染，由此引发了不少污染纠纷。国土环境资源厅日前发出《关于加强养猪场污染防治有关问题的通知》，就养猪场污染防治工作提出了具体意见，要求各市、县督促各养猪业主按要求对猪场进行整改和治理。
相当部分养猪场目前大多采用水法清粪处理工艺，直接用自来水冲洗粪便，导致COD（有机耗氧量）、氨氮、总磷等浓度偏高。环保部门要求养猪场要采用干法清粪工艺，采取有效措施将粪及时、单独清出，不可与尿、污水混合排出，并将产生的粪渣及时运至贮存或处理场所，实现日产日清。采用水冲粪、水泡粪湿法工艺的养猪场，要限期改为干法清粪工艺。
目前，大部分养猪场未严格执行环境保护“三同时”制度，无完善的污水处理设施，相当部分养猪场污水仅进行简单处理便外排或用于农灌，对造成部分地表水体污染。
环保部门要求现有的养猪场须完善污水处理系统，养猪过程产生的污水应坚持种养结合的原则，经厌氧等无害化处理后尽量充分还田，氧化塘应采取防渗漏、防溢流措施，实现污水资源化利用。
因养猪粪肥含有蛔虫卵和粪大肠菌群数，环保部门要求，采取土地利用方式处理粪便的，粪便须经过无害化处理，符合《粪便无害化卫生标准》后才能利用。同时，要充分考虑作物生长的需要，其用量不能超过作物当年生长所需要养分的需求量。禁止未经处理的粪便直接施入农田。对没有充足土地消纳利用粪肥的大中型养猪场和养殖小区，应建立集中处理粪便的有机肥厂或处理（置）机制，防止粪便随意丢弃污染环境。
