1、起源不同
哈密瓜（哈密瓜一般指甜瓜）：
根据甜瓜近缘野生种和近缘栽培种的分布，认为热带非洲的几内亚是甜瓜的初级起源中心，经古埃及传入中近东、中亚（包括中国新疆）和印度。在中亚演化为厚皮甜瓜。中国是薄皮甜瓜的初级和次级起源中心，12-13世纪由中亚传入俄国国，16世纪初由欧洲传入美洲，19世纪60年代从美洲传入日本。传入印度的甜瓜进一步分化出薄皮甜瓜，再传入中国，朝鲜和日本。中国华北是薄皮甜瓜的次级起源中心。
香瓜：
甜瓜植物的起源甜瓜种的起源中心在非洲埃塞俄比亚高原及其毗邻地区。美国的小科克布莱德列举出Cucumis属约29个近缘种，大多起源和分布在非洲。因此，非洲应是甜瓜的初生起源中心。但是，甜瓜（Cucumis melo）种内栽培亚种subsp及变种cultivars却远远超出其初生起源地非洲，而广泛分布于亚欧大陆的西亚（土耳其）、地中海沿岸的北非和南欧，中亚的伊朗、乌兹别克斯坦、土库曼斯坦和中国（新疆），东亚的中国（黄河和长江流域）、朝鲜、日本，南亚的印度以及美洲新大陆。
2、生长环境不同
哈密瓜（哈密瓜一般指甜瓜）：
甜瓜最适宜种植在土层深厚，通透性好，pH值5.5-8.0，不易积水的沙壤土上。甜瓜喜光照，每天需10-12小时光照来维持正常的生长发育。甜瓜喜温、耐热、极不抗寒。
种子发芽温度15-37℃，早春露地播种应稳定在15℃以上，以免烂种。植株生长温度以25-30℃为宜，在14-45℃内均可生长。开花温度最适25℃，果实成熟适温30℃。而气温的昼夜温差对甜瓜的品质影响很大。昼夜温差大，有利于糖分的积累和果实品质的提高。
香瓜：
厚皮甜瓜不耐过高的土壤和空气湿度，要求有充足的光照和较高的温度（尤其结瓜期），以及较大的昼夜温差。中晚熟品种整个生长期要求15℃以上的积温3000-4000℃。生育最适温度是25-30℃。
要求日照强烈而充足。光饱和点为5.5-6.0万lx。每天13-14小时日照可以使生长加快，促进早熟；日照少于10小时，对厚皮甜瓜已有不良影响，晚熟品种整个生长期要求日照时数1700-1800小时。
哈密瓜：
香瓜：
3、主要价值不同
哈密瓜（哈密瓜一般指甜瓜）：甜瓜是夏令消暑瓜果，果肉生食。甜瓜可制成瓜干、瓜脯、甜瓜汁、甜瓜块罐头、瓜酒、瓜酱、腌甜瓜等。
甜瓜每100克果肉含水分90-93克、碳水化合物9.8克、维生素C29-39毫克，还含有少量蛋白质、脂肪、矿物质及其他维生素等。
香瓜：
含有大量的碳水化合物及柠檬酸、胡萝卜素和维生素B、C等，且水分充沛，可消暑清热、生津解渴、除烦等。瓜中含有转化酶，可以将不溶性蛋白质转变成可溶性蛋白质，能帮助肾脏病人吸收营养，对肾病患者有益。
瓜蒂所含的葫芦素B能明显增加实验性肝糖元蓄积，减轻慢性肝损伤，从而阻止肝细胞脂肪变性及抑制纤维增生。 瓜蒂含有苦毒素，葫芦素B、E等结晶性苦味质，能刺激胃粘膜，内服适量，可致呕吐，但不为身体吸收，而无虚脱及中毒等弊端。瓜肉含有蛋白质、脂肪、碳水化合物、无机盐等，可补充人体所需要的能量及营养素，帮助机体恢复健康。
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