水泡粪清粪是在猪舍内的排粪沟中注入一定量的水，粪尿、冲洗和饲养管理用水一并排放缝隙地板下的粪沟中，储存一定时间后（一般为1～2个月），待粪沟装满后，打开出口的闸门，将沟中粪水排出。粪水顺粪沟流入粪便主干沟，进入地下贮粪池或用泵抽吸到地面贮粪池。运行费用主要包括：水费、电费和维护费。一头猪每天需用水10～15升，电费主要来闸门自动开关系统和污水泵用电。
水泡粪清粪优点为：比水冲粪工艺节省用水和节省人力，工艺技术不复杂，不受气候影响。
水泡粪清粪缺点为：由于粪便长时间在猪舍中停留，形成厌氧发酵，产生大量的有害气体，如H2S（硫化氢），CH4（甲烷）等，恶化舍内空气环境，危及动物和饲养人员的健康。粪水混合物的污染物浓度更高，后处理也更加困难。另外，污水处理部分基建投资及动力消耗也较高。
目前猪场清粪方式有干清粪、水泡粪、发酵床和刮粪机的模式，有网友认为水泡粪相对来说比较好，因为水泡粪可以节省占地面积，投资也不大；水泡粪也可以节省清粪时间，不用出粪。如果再配备好的地沟风机，再加上猪粪经过发酵后会在粪表面形成生物膜，可以防止氨气、硫化氢等有害气体的透出，降低环境污染。
干清粪虽然节省一点点粪坑和管道的投资，但要配备粪车、铁锹、扫把和冲水管，且管理效率低，大部分时间都在扫圈出粪。
发酵床主要是垫料的购买运输和菌种，还要定期翻动垫料，消毒还得注意不得伤害菌种，管理效率低、饲料浪费大。
刮粪机虽然效率跟水泡粪效率差不多，但刮出的干粪还需要运走，还需要处理、也不如水泡粪干净。
另外，水泡粪能帮助猪场留住大、中专生，留住美女，留住年轻人，出粪又脏又臭，这是很多大中专生、很多美女、很多年轻人不愿干的事情，如果猪场不能留住大中专生、美女和年轻人，我们的养猪业是不能进步的，也是没有前途的！美国目前有2.4米-3米的深坑式水泡粪模式，一年只出一次粪，加上自动料线、高压自动喷雾消毒系统和自动温控系统，高自动化要求从业人员必须具有本科以上学历，这就是我们未来养猪的重要模式之一，比较适合土地广袌的东北、西北。虽然水泡粪有政府反对之嫌，但水泡粪排出的粪水在污水处理厂进行干清粪类似的处理后达标排放也未尝不可。
