微污染只要指影响水产育苗的重金属、以及农药、除草剂、杀菌消毒剂、抗生素等环境激素污染。这些污染物种类较多，性质复杂，但浓度较低，通常被称为微污染水。对育苗影响最大的微污染物为重金属和环境激素，虽然浓度比较低微，但是对育苗毒害很大，尤其是那些难于降解、易于生物积累和具有“三致”作用的环境激素。
微污染物大多为人工合成有机物，种类繁多，包括：石油烃、挥发酚、农药、杀菌消毒剂、砷、氯化物等环境激素。
其特点是分子量小，本身就是杀生剂，难以为微生物降解，采用一般的过滤和生化方法无法除去，虽然含量低（多在微克/升水平），但毒性强，对水产育苗构成极大的威胁。
环境激素对养殖动物幼体毒性非常强。
