水稻烂秧包括烂种、烂芽和烂秧3种。在育秧期间低温阴雨天气多，则不利于水稻缺苗的生长，秧苗长势弱，易受病菌侵害，因而烂秧现象时有发生，严重时缺秧影响水稻栽插，为防治水稻烂秧，要抓好如下几项措施。
（1）选种。
要选用谷粒饱满、发芽率和发芽势高的种子，杂交稻种子不饱满粒与饱满粒要分开播种，分级管理。
（2）晒种。
种子在浸种前要晒种2～3天，以提高种子的吸水速率和发芽势。
（3）消毒。
种子要用36%三氯异氰尿酸浸种消毒，恶苗病严重的地区或品种可用咪酰胺浸种消毒。（4）浸种催芽。
播种前先挑出有病和有虫的种子，用0.0016%芸薹素内酯浸种6～12小时，晾干即可播种。可促进营养物质转化和胚的萌动，提高抗低温能力，增加发芽率和发芽势，促进出苗整齐。
（5）保温。
采用地膜保温育秧是防治水稻烂秧最有效的措施，应在播种后立即盖膜保温，在现青前一般保持密封，以后要注意通风炼苗，提高秧苗的抗逆性，移（抛）栽前10天左右选择晴天上午揭膜。
（6）施肥。
在秧田施足有机肥，用壮秧剂或育秧肥等具有防病、化控、营养等多种功能的水稻育秧专用肥料育秧，同时，为促进秧苗生长和分蘖，提高秧苗的抗低温能力和吸肥强度，增强秧苗综合素质，在揭膜后还可喷施丰硕481和追施钾肥。
（7）灌水。
最好采用旱床育秧或抛秧盘育秧，采用湿润育秧也应在2叶1心前保持畦面无水，以提高秧田的通气性和促进根系的生长，增强抗逆性。旱床育秧和秧盘育秧整个秧田期旱育，湿润育秧在2叶1心前旱育，以后可水育，但在揭膜时为防止因生理缺水而死苗，应浇水或灌水。
（8）防病。
一般在种子消毒的基础上，再应用多功能水稻育秧肥料育秧，基本上都能达到防病的效果，但如果后期发生病害要立即用药剂防治。
