（1）意义和目的不同。
温室无土育苗的目的是使产品提前上市增加经济收入，保证市场供应；而家庭蔬菜无土育苗和花卉同样有观赏、绿化、净化室内空气的作用。无土育苗环境清洁无污染，有利于环境保护。既可使儿童了解无土栽培蔬菜的简单知识，也是儿童活的生物课本，同时又给老年人增添乐趣。
（2）所用无土育苗基质与温室不同。
家庭所用无土育苗基质应以美观、体轻、无异味、可反复利用、对环境无污染为条件，而温室无土育苗不需考虑这些。
（3）所用营养液不同。
温室多为专业生产，所用营养液多为各种蔬菜专用营养液，而家庭由于条件所限，不可能存有多种营养液，一是怕混乱用错，二是不方便，所以家庭使用营养液最好是通用液或“家庭蔬菜无土栽培综合营养液”。
（4）育苗设施不同。
温室大规模生产无土育苗多采用机械化穴盘育苗，而家庭生产量小，基质育苗可用废饮料杯，水培、岩棉培用岩棉块育苗即可。
（5）品种的不同。
温室育苗所用品种是要考虑产量高和市场是否畅销，而家庭所用品种多考虑观赏价值和品味以及适合家庭环境条件的品种。
（6）环境小气候条件不同。
温室环境是根据蔬菜生长条件设计的，如光照、温度和空气相对湿度都是可以调节的。而家庭环境小气候条件是由人的生活居住环境所决定的。一年四季气候的变化，使室内所受光照与温室大不相同。另外，北方与南方不同，北方冬季供暖，使室内小气候具备了特有的条件。各家各户的小气候条件也不同。
酿热温床、草围温床、电热温床、塑料大棚冷床等保护地育苗设施，各有优劣，在生产上应根据各地的实际情况，因地制宜地选用。
酿热温床和草围温床由于床内填有酿热物，温度较高，适宜秧苗生长，苗期时间短，管理费工少，播种时间晚一点，也不妨碍种子的发芽和幼苗的生长，但酿热物需要量大，花费较多，故培育苗期较长的茄果类蔬菜苗不够经济，但适宜苗龄较短的瓜豆类蔬菜早春早熟栽培育苗。
电热温床育苗出苗快而齐，能在较短的时间内培育出适龄壮苗，能实现温度的自动控制，便于管理、省工。适宜培育茄果类和瓜、豆类蔬菜秧苗，但一次性投资大，而且电费昂贵，目前还难在生产上普遍应用，随着我国电力工业的发展、电费的降低，今后将会有广阔的发展前景。
对塑料大棚冷床培育茄果类蔬菜长龄大苗，过去许多人有不同看法，认为在露地栽培时，茄子生理苗龄在5.8叶龄较为合适，也有人认为茄子日历苗龄在100天为适宜苗龄，如苗龄过长，定植后缓苗慢，门茄易落花，同时占用苗床时间长，不经济。作者曾对成都市郊电热温床育苗、草围温床育苗及塑料大棚冷床育苗情况进行了调查，3种育苗方式的茄苗素质如表8。
表8 3种育苗方式茄苗素质的比较（10株平均值）
将塑料大棚冷床苗和电热温床苗在塑料大棚加地膜覆盖条件下栽培，当采用一定技术措施后，均未出现僵苗现象，缓苗较快，由于塑料大棚育的茄苗生理苗龄大、发育早，较电热温床育的生理苗龄较小的茄苗生长快，采收早，每株结果数多7～8个。据生产调查草围温床苗的生长状况和早熟性则介于这两种苗之间。故苗龄过长虽是育苗所忌讳的，在露地栽培易成老僵苗，但在先进的栽培技术下，能克服易成僵苗的弊端，发挥其早发育的特性，而比适龄壮苗早熟、丰产，使矛盾得到了转化。
再就是苗子的价格问题，由于育苗采用的设施、能源、用工量等成本不同，所以价格也有差异，像上述的3种茄苗，塑料大棚冷床苗的售价为每株0.15元左右，草围温床苗为每株0.20～0.25元，在用电热温床育茄苗时，因考虑到电费昂贵的问题，故育苗时苗距为3.5厘米，每株苗价格为0.06元，但这种苗在塑料大棚中栽培达不到早熟、丰产的效果。如将苗距放大到9厘米，育成与塑料大棚冷床所育的同样大小的苗子，据测算成本将达到每株0.30元，无法与塑料大棚冷床苗竞争。
塑料大棚冷床育苗虽占地时间较长，但并非不经济，以667米2塑料大棚使用面积为90%计，以9厘米×9厘米苗距育苗时，每667米2可育茄子大苗7万多株，由于只进行一次假植，假植用工比草围温床育苗大大减少（草围温床育大苗时，要经过4～5次假植），只是在冬季需进行棚膜的揭盖和病虫害防治，用工不多，每667米2大棚在半年时间育苗可收入1万多元，收入不算低。塑料大棚冷床育苗提早播期至9月下旬这一技术革新，使其在11月初假植时，地温尚高，不需加温，充分利用了太阳能、节省了能源、降低了成本（如11月初播种，在12月份假植时，地温低于茄子根毛发生的温度极限，则需消耗能源，会加大成本）。由于假植次数少，伤根缓苗的次数少，所以苗子的干物重较草围温床苗大2～3倍，更早熟、丰产。
塑料大棚冷床育苗设施简单，技术不复杂，不像电热温床需要大的投资，可在四川、重庆、贵州的日照少的地区用于培育茄果类蔬菜大苗，是一项新的茄果类蔬菜育苗技术。
