江苏农牧科技职业学院的农业工程学院设有机电一体化技术、数控技术、农业装备应用技术、汽车检测与维修技术四个专业。
一、机电一体化技术
主修课程：主要开设《AutoCAD》、《单片机技术》、《电气控制与PLC》、《机械设计技术》、《传感器与检测技术》、《无人机技术》等专业课程。
培养目标：对接中国制造2025，培养掌握机械技术和电气技术的基础理论和专业知识，具备相应实践技能以及较强的工作能力，熟练进行机电一体化技术的应用、设备的安装、调试、维护及销售和技术服务的高素质技术技能人才。
二、数控技术
主修课程：主要开设《AutoCAD》、《数控机床》、《电气控制与PLC》、《数控加工工艺》、《数控加工编程》、《数控机床故障与维修》等专业课程。
培养目标：对接中国制造2025，培养具有必要的理论知识和较强的实践能力，能够从事数控设备的操作、安装、调试、维护、营销和管理第一线工作，具有一定创新创业能力的高素质技术技能人才。
三、汽车检测与维修技术
主修课程：主要开设《汽车发动机构造与维修》、《汽车电工电子技术》、《汽车底盘构造与维修》、《汽车维护与保养》、《汽车电器设备与维修》、《汽车电控系统检修》等专业课程。
培养目标：本专业主要面向汽车相关的行业企业，培养在经营、服务一线能从事汽车维护与保养、汽车检测与维修、汽车售后接待与管理、车辆鉴定、评估、保险、事故察勘理赔等工作，具有一定创新创业能力的高素质技术技能人才。
四、农业装备应用技术
主修课程：本专业主要开设《农机发动机构造与维修》、《作业机械使用与维护》、《农机电气设备与维修》、《农机底盘构造与维修》、《UG三维设计》、《农机营销与推广》等专业课程。
培养目标：本专业面向农业装备制造企业、农机合作社、农机流通企业、农机服务企业等，掌握农业装备使用操作、装配与调试、检测与维修、营销、技术服务等技能，从事现代农业装备作业、维修、装配、营销等一线工作的高素质技术技能人才。
2016年江苏农牧科技学院共有41个专业招生。
序号，专业代码 ，专业名称(方向） ，所属院系
1 ，510301，农牧兽医，动物科技学院?
2，510308，饲料与动物营养，
3，510302，动物医学，动物医学院
4，510304，动物防疫与检疫
5，510305，动物医学检验技术
6，510303，动物药学，动物药学院
7，590202，药品生产技术
8，590204，药品质量与安全
9，510113，农产品加工与质量检测，食品科技学院?
10，510313，养蜂与蜂产品加工
11，590101，食品加工技术
12，590107，食品营养与检测
13，590103，食品质量与安全
14，510302，动物医学 (宠物医学)，宠物科技学院。?
15，510306，宠物养护与驯导
16，510306，宠物养护与驯导（宠物护理与美容)
17，510307，实验动物技术,
18，510107，园艺技术，园林园艺系
19，510202，园林技术，20，510110，中草药栽培技术，
21，540106，园林工程技术
22，650111，环境艺术设计
23，510401，水产养殖技术，水产科技系
24，510403，水族科学与技术
25，510404，水生动物医学
26，510105，休闲农业，农商管理系
27，630701，市场营销 ?
28，630302，会计
29，630903，物流管理
30，640101，旅游管理
31，630801，电子商务
32，510103，设施农业与装备（农业物联网技术），农业物联网系
33，610119，物联网应用技术
34，610201，计算机应用技术
35，610202， 计算机网络技术
36，610301，通信技术
37，510117，农业装备应用技术，农业工程系
38，510310，畜牧工程技术
39，560301，机电一体化技术
40，630702，汽车营销与服务
41，560103，数控技术
