中草药害虫种类繁多，除受一般农作物害虫危害外，其本身还有一些特有害虫。现简要介绍如下：
（1）蚜、蚧、螨类等刺吸口器害虫：蚜虫是中草药的重要害虫类群，危害十分普遍。据调查桃蚜可危害数十种中草药。中草药还有一些特有的蚜虫种类。如危害红花、牛蒡等的红花指官蚜Uroleucon gobonis（Matsumura）、危害萝蘼科药材的萝蘼蚜Aphis asclepiadis Fitch等。介壳虫主要危害一些南方生长的中草药，尤其是木本南药受害较重，如危害槟榔的椰圆盾蚧，危害多种中草药的日本龟蜡蚧（Ceroplastes japonicus Green）等。少数中草药受螨类危害较重，如危害地黄的棉叶螨，危害枸杞的瘿螨（Eriophyes sp.）等。这类害虫吸食中草药汁液，造成黄叶、皱缩，叶、花、果脱落，严重影响中草药生长和产量、质量。有些种类还是传播病毒病的媒介，造成病毒病蔓延。由于发生量大，世代多，用药水平较高，如何防止或减少农药污染，是个值得重视的问题。
（2）地上部咀嚼口器害虫：这类害虫主要咀食中草药叶、花、果等，造成孔洞或被食成光秆。如危害伞形科中药的黄凤蝶幼虫，危害枸杞的枸杞负泥虫（Lema decempunctata Gebler），危害板蓝的青菜虫等，危害都很严重。金银花受尺蠖危害，几天内可被吃光秆，造成严重损失。
（3）钻蛀性害虫：钻蛀性害虫是中草药的一类危害重、防治难度较大，造成经济损失较大的类群。危害中草药的钻蛀性害虫主要有蛀茎性害虫如金银花咖啡虎天牛（Xylotrechus grayii White）、菊天牛、肉桂木蛾（Thymaiatris sp.）等；蛀根茎类害虫如北沙参钻心虫（Epinotialancantha Meyrick）等；蛀花、果害虫如槟榔红脉穗螟（Tirathaba rufivena Walker）、枸杞实蝇等，蛀种子害虫如黄芪种子小蜂（Bruchophagus spp.）等。
（4）地下害虫：地下害虫是主要危害植物地下部分又生活在土壤里的害虫。地下害虫种类很多，包括蝼蛄、金针虫、地老虎、根蛆、根蚜、根蚧、白蚁等，但以前四种危害最普遍。因中草药中根部入药者居多，地下害虫直接危害药用部位，致使商品规格下降，影响产量和质量。
综合防治
中草药病虫害防治的基本策略是实施“预防为主，综合治理”的指导思想和安全、有效、经济、简易的原则，因地制宜，合理运用农业的、化学的、生物的、物理的方法是其有效的生态手段，把有害生物的为害控制在经济阔值以下。中药材是人民用于治疗疾病或保健的特殊商品，其中一部分已正式列为食品之列。因此中药材的安全无污染则显得更为重要。近年来，我国中药行业已逐步对绿色中药材的研究和开发予以重视。绿色中药材的生产和基地建立已成为中药现代化的重要内容之一。为此，中草药病虫害防治工作中一定要防止和减少污染，使中药材的生产符合绿色中药材的要求。
农业防治
农业防治是通过调整栽培技术减少病虫害发生的方法。这些措施大多数是预防性的，体现了预防为主的精神。农业措施一般不增加开支，安全有效，简单易行。
(1)合理轮作和间作 一种中草药在同一块地上连作，就会使其病虫源在土中积累加重。进行合理轮作和间作对防治病虫害和充分利用土壤肥力都是十分重要的。特别对那些病虫在土中寄居或休眠的中草药，实行轮作更为重要。如土传发生病害多的人参、西洋参绝不能连作，老参地不能再种参，否则病害严重。如人参与水稻轮作数年，浙贝母与水稻隔年轮作，分别可大大减轻根腐病和灰霉病的为害。大黄与川芎或黄芪轮作可减轻大黄拟守瓜的为害。合理选择轮作物对象很重要，同科、属植物或同为某些严重病虫害寄主的植物不能选为轮作物。
(2)耕作 很多病原菌和害虫在土内越冬。因此，冬耕晒垡可以直接破坏害虫的越冬。因此，冬耕晒垡可以直接破坏害虫的越冬果穴或改变栖息环境，减少越冬病虫源。例如对土传病害发生严重的人参、西洋参等，播前除必须休闲地外，还要耕翻晒土几次，以改善土壤物理性状，减少土中病原菌数量，达到防病的目的。
(3)除草、修剪和清洁田园 田间杂草和中草药收获后的残枝落叶常是病虫隐蔽及越冬场所和来年的重要病虫来源。因此，除草、修剪病虫枝叶和收获后清洁田园将病虫残枝和枯枝落叶进行烧毁或深埋处理，可大大减少病虫越冬基数，是防治病虫害的重要农业技术措施。
(4)其他农业措施 调节中草药播种期，使其病虫的某个发育阶段错过病虫大量侵染为害的危险期，可避开病虫为害达到防治目的。其他还有合理施肥，选育抗病虫品种等都是重要的农业防治技术。
