生物农药概括起来主要具有以下几方面的优点：（1）选择性强，对人畜安全。目前市场开发并大范围应用成功的生物农药产品，它们只对病虫害有作用，一般对人、畜及各种有益生物（包括动物天敌、昆虫天敌、蜜蜂、传粉昆虫及鱼、虾等水生生物）比较安全，对非靶标生物的影响也比较小。（2）对生态环境影响小。生物农药控制有害生物的作用，主要是利用某些特殊微生物或微生物的代谢产物所具有的杀虫、防病、促生功能。其有效活性成分完全存在和来源于自然生态系统，它的最大特点是极易被日光、植物或各种土壤微生物分解，是一种来于自然，归于自然正常的物质循环方式。因此，可以认为它们对自然生态环境安全、无污染。（3）可以诱发害虫流行病。一些生物农药品种（昆虫病原真菌、昆虫病毒、昆虫微孢子虫、昆虫病原线虫等），具有在害虫群体中水平或经卵垂直传播的能力，在野外一定的条件之下，具有定殖、扩散和发展流行的能力。不但可以对当年当代的有害生物发挥控制作用，而且对后代或者翌年的有害生物种群起到一定的抑制作用，具有明显的后效作用。（4）可利用农副产品生产加工。目前国内生产加工生物农药，一般主要利用天然可再生资源（如农副产品的玉米、豆饼、鱼粉、麦麸或某些植物体等），原材料的来源十分广泛，生产成本比较低廉。（5）害虫不易产生抗性。生物农药一般有效成分较多，对害虫的作用位点更多，因而害虫不易产生抗性，或产生抗性时间较长。但是，生物农药产品与化学农药相比也存在许多本身固有的弱点，简要概括起来主要包括以下几点：①防治效果一般较为缓慢；②有效活性成分比较复杂；③控制有害生物的范围较窄；④易受到环境因素的制约和干扰；⑤产品有效期短、质量稳定性较差。
在我国，发展和使用生物农药有多方面的意义。首先，在新农药开发方面，生物农药相对于化学农药较为容易。筛选一个新的化学农药的几率只有二万分之一，而生物农药的成功率是五千分之一；化学农药的开发周期是生物农药的3倍，开发费用是生物农药的40倍。
其次，生物农药具有选择性强，对人、畜和天敌安全，对自然生态环境安全等优点。大多数生物农药靶标专一，有些作用方式是非毒杀性的，对人、畜及各种有益生物比较安全；生物农药的有效成分完全存在或源于自然，因此，它对环境的兼容性好、无污染；生物农药的作用机理特异，有害生物不易产生抗药性。
一些生物农药品种（昆虫病原真菌、昆虫病毒、昆虫微孢子虫、昆虫病原线虫等），具有在害虫群体中的水平或经卵垂直传播能力，在野外一定的条件之下，具有定殖、扩散和发展流行的能力。不但可以对当年当代的有害生物发挥控制作用，而且对后代或者翌年的有害生物种群起到一定的抑制，具有明显的后效作用。
另外，生产生物农药可利用天然可再生资源（如农副产品中的玉米、豆饼、鱼粉、麦麸或某些植物体等），原材料的来源十分广泛。因此，生产生物农药一般不会产生与利用不可再生资源（如石油、煤、天然气等）生产化工合成产品争夺原材料的矛盾，有利于人类自然资源保护和永久利用。
但是，生物农药在开发、生产和使用方面也存在着一些问题：①有些生物农药有效活性成分复杂，质量难以控制；②生物农药的有效成分多是一些生物体或稳定性差的物质，产品的质量保证期短；③外界环境的温度、湿度、光照等对生物农药的影响较大，对生产、加工、储运和使用的要求较严格，由于环境条件的不同，在使用时常出现防治效果不稳定、时好时差的现象；④与化学农药相比，大部分生物农药防治效果较为缓慢；⑤生物农药品种专一性强，对其他有害生物的兼治性较差。
