该院下设水力工程与防洪减灾研究所、河流海岸工程研究所、农业水利与水保生态工程研究所、岩土工程研究所、结构材料研究所、水利信息与自动化研究所、农村水利水电工程研究所，及勘测设计院、水利水电加固工程公司、经济开发公司等科技开发实体。建有广东省水动力学应用研究重点实验室、广东省水利重点科研基地和广东省水利试验基地，拥有大型现代化试验厅和其他专业试验室20多个，面积70000多平方米，配备了基于工业以太网的新型水力物理模型试验测控系统，并装备有目前国际先进水平的三维造波机、移动式二维造波机、风浪水槽、地震仪和地质雷达等先进科学仪器设备1000多台（套）。广东省水利工程质量检测中心站、广东省电站泵站测试中心、广东省水利水电科技情报中心、广东省中心灌溉试验站、广东水利水电编辑部、水利部广东检索查新工作站均设在该院。
1、保定市王快水库管理处
负责水库、灌区工程的建设、管理、运行安全等工作;负责水库安全度汛工作;负责灌溉、供水工作;负责库区水事活动监督检查,配合市水政监察支队做好相关水政执法工作;保护库区水资源和水利工程设施。 2、保定市西大洋水库管理处 负责水库、灌区工程的建设、管理、运行安全等工作;负责水库安全度汛工作;负责灌溉、供水工作;负责库区水事活动监督检查,配合市水政监察支队做好相关水政执法工作;保护库区水资源和水利工程设施。 3、保定市安格庄水库管理处 负责水库、灌区工程的建设、管理、运行安全等工作;负责水库安全度汛工作;负责灌溉工作;负责库区水事活动监督检查,配合市水政监察支队做好相关水政执法工作;保护库区水资源和水利工程设施;负责水利风景区的管理与服务。 4、保定市龙门水库管理处 负责水库、灌区工程的建设、管理、运行安全等工作;负责水库安全度汛工作;负责库区水事活动监督检查,配合市水政监察支队做好相关水政执法工作;保护库区水资源和水利工程设施。 5、保定市水利防汛抗旱服务中心 为全市水利防御洪水防御旱灾提供法规政策咨询和技术服务;参与编制全市洪水干早灾害防治规划和防护标准、各类水利防洪预案和重点防洪工程的度汛措施的前期调研、分析和论证工作;为重要河道湖泊和重要水工程防汛抗旱调度和应急水量调度提供技术服务;承担全市水利防汛抗旱信息收集整理、水旱灾情统计、核查和防汛抗旱效益与减灾效益评估工作;组织开展全市水利水情实时信息收集整理工作。 6、保定市水资源服务中心(保定市城市节水服务中心) 为全市水资源利用、节约、保护、城乡供水等提供法规政策咨询和技术服务;为全市水资源管理工作提供支持保障服务;承担城市节约用水方面的服务性工作。 7、保定市水库移民服务中心 配合县(市区)做好水库移民稳定工作。 8、保定市水电及农村电气化发展中心 为全市水能资源调查评价及开发利用规划编制提供服务;承担水能资源开发使用许可论证工作;指导农村水电行业技术进步、技术推广和人员培训;承担农村水电信息系统建设和全市农村水电统计等工作。 9、保定市水利局水利信息中心 负责全市防汛通讯专网的规划、设计、建设、管理与维护;负责全市防汛抗旱指挥中心、大中型水库、蓄滞洪区通讯预警系统的建设、管理与安全;受主管部门委托,承担市水利局信息自动化及网络的建设、管理和维护。 10、保定市水土保持工作站 为全市水土流失和生态环境治理以及重点小流域的综合治理提供法规政策咨询和技术服务;承担对开发建设项目水土保持方案的技术审查和服务;承担水土流失预防和监督管理的技术指导:承担全市水土保持技术规程、标准的编制及技术论证工作;承担水土保持宣传、人才培训、技术服务和新技术推广工作。 11、保定市水土保持试验站 开展水土保持科学试验研究;开展水土保持生态环境建设及山区综合治理开发新技术示范与推广;开展水土保持生态环境监测。 12、保定市灌溉试验站 承担全国灌溉试验站网安排的灌溉农业基础数据采集和需要长期开展的灌溉试验任务;承担全国灌溉试验协作研究任务;承担农田灌溉试验、农业节水增效减灾技术、农业用水效率监测与评估工作;承担河北省设置的节水灌溉科研课题及研究成果的示范推广工作;为河北省乃至全国节水灌溉的发展提供技术支持;为全市科学灌溉,节约水资源,保护水环境,维护生态环境等提供技术支持;承担灌溉试验基地的建设及运行工作。 13、保定市水政监察支队(保定市水利工程质量安全技术中心) 按照管理权限,受主管部门委托,宣传贯彻相关法规;对水库库区进行水政执法,对水库及其他水源地保护工作和水事活动进行监督检查;保护水资源、水域、水工程、水土保持生态环境、防汛抗旱和水文监测等有关设施;配合和协助公安和司法部门查处水事治安和刑事案件;对县(市、区)水政监察队伍进行指导和监督;为水利工程施工安全、质量管理、质量投诉提供法规政策咨询和技术服务。 14、保定市城区水系管理服务中心 承担城区水系管理维护工作;负责城区规划区内防汛及河道、堤防的维护管理工作,承担水利设施及其附属设施的工程维修、养护和管理工作:承担唐河干渠末端至府河与金线河汇流口新建工程的运行管理工作。 15、保定市水利物资服务站 负责全市防汛抗旱物资的计划、采购;负责全市防汛抗旱物资储备、保管、维护保养、检查、核销、更新回收、调配运输;负责代省储防汛物资的管理、管护和保养协助调配和运输。 16、保定市水利水电勘测设计院 17、保定市建筑安装工程处 18、保定市打井公司
