当焊烟净化器启动，风机会产生负压，而焊接散发出来的烟尘就会由于风机的负压作用经由设置的吸气臂吸入除尘器里，吸气臂末端装有一层阻火网，来防止火星的进入，保护净化器；焊烟进入到过滤室以后，大颗粒的灰尘会直接落入灰斗，而小颗粒的烟尘则有滤筒进行过滤，过滤后的空气会由排风口排出，截留下来的焊烟颗粒会被吸附在滤筒表面，经过一段时间的过滤，滤筒表面会积有一层厚厚的灰尘，这时候焊烟净化器的清灰系统开始对滤筒进行清灰，利用压缩空气的喷吹，将灰尘抖落。整个烟尘净化的过程就这样循环往复。
而焊烟净化器能够净化烟尘的关键就在于滤筒，这种滤筒的表面有一层PTFE覆膜，覆膜的孔径非常小，粉尘是通不过这层覆膜的，因而会沉积在滤筒表面，达到过滤的效果。但粉尘的沉积会降低滤筒的过滤效果，所以焊烟净化器配有清灰系统，定期对滤筒进行清洁。
