黄鳝属冷血变温动物，其体温会随环境温度的变化而变化。适宜黄鳝生存的水温为1-32℃，适宜黄鳝生长的水温为15-30℃，最适黄鳝生长繁殖的水温为21-28℃，此时摄食活动强，生长较快。水温低于15℃时，黄鳝吃食量明显下降，10℃以下时，则停止摄食，随温度的降低而进入冬眠状态。
当水温超过 30℃以上时，黄鳝行动反应迟钝，摄食停止，长时间高温或低温甚至引发黄鳝死亡。黄鳝具有自行选择适温区的习性，当所栖息的环境水温不适时，黄鳝会自动寻找适宜的区域，当长时间找不到适宜生存的水温环境，就会致使黄鳝的生理功能紊乱，诱发疾病甚至死亡。在高温状态下，黄鳝频繁伸头出水面呼吸空气，因此，当水面气温过高（高于32℃），同样会对黄鳝的正常呼吸产生不良影响。
此外，黄鳝对水温的骤然变化也非常敏感，因而在人工养殖中，若对水温调控不当时常会导致黄鳝患上感冒病。
