办理港口码头的不动产权证需要按照以下步骤进行：
1.查阅相关法律法规：首先，了解当地关于不动产权证办理的法律法规，包括港口码头的特殊规定。
2.准备材料：收集办理不动产权证所需的材料，包括但不限于：
港口码头的土地使用证明或租赁合同；
港口码头的建设规划和设计文件；
港口码头的土地测绘报告；
相关权属证明文件，如土地证、房产证等；
申请人的身份证明、委托书等个人材料。
3.咨询相关部门：联系当地港务局或土地管理部门，咨询具体办理流程和所需材料清单。
4.提交申请：按照要求填写申请表格，并将准备好的材料一并提交给相关部门。
5.审核和评估：相关部门将对提交的申请材料进行审核和评估，包括对港口码头的合法性、土地使用情况等进行核实。
6.缴纳费用：根据当地规定，缴纳不动产权证办理费用。
7.领取证书：经过审核通过后，申请人可以前往相关部门领取港口码头的不动产权证。
需要注意的是，具体办理流程和所需材料可能因地区而异，建议在办理前与当地相关部门进行详细咨询，以确保办理顺利。
