1、种子根发育期：床土保持旱育状态，棚外最低温度低于8℃，采取昼夜保温措施，棚外温度15℃开始通风炼苗，昼揭夜盖。出苗80%时，撤掉地膜，增加光照，促进绿化。
2、第一完全叶伸长期：此时外界温度变化很大，不能一味采取保温措施。通常要求棚温控制在22-25℃，最低气温低于10℃（棚温12-15℃）采取保温措施，最高温度超过28℃采取降温措施。在湿度管理上坚持不浇水的原则。
3、离乳期：此时要求棚温控制在22-25℃。具体根据气温变化，多设通风口进行通风炼苗，避免通底风，防青枯病发生。此时秧苗根部土壤温度低于8℃不浇水、棚外气温低于10℃时不浇水、中午棚温高峰期不浇水，水温低于16℃不能作为苗床用水。浇水一般在上午8点前或下午3点到5点进行，浇水要一次性浇透。
苗床管理要因时因地因天气而采取不同的管理办法，且苗床管理容易出现的问题，要以预防为主。
（1）连续阴天
在连续阴天的环境里，苗床的温度不容易升上来，水分不容易散失。阴天要控制温度，特别是控制夜间的温度，不要低于8℃，以免影响根系生长发育。当夜间最低温度达到-3℃以下时，要采取增温措施，避免冻害发生。
（2）晴天管理
晴天管理的要点是温度不能过高，未出苗以28℃以内为宜；一叶一心以25℃～28℃为宜；二叶一心以22℃为宜。对于棚内的空气湿度，以不见蒸汽为标准。有好多人认为苗小不能通风，这是非常错误的，未出苗如果温度高了也要通风。
（3）土壤水分管理
首先是看苗床土表面是否发白，如果发白，说明表面已经缺水。再看秧苗的根，底土不缺水，就不用浇水。早上发现秧苗吐水的水珠变小，在中午前后，秧苗出现连片打绺现象，这时候才是要浇水的表现。但一栋大棚中不是所有的苗都同时出现这样的现象，哪里干了浇哪里，其他地方不要浇。
判断土壤水分多少的方法是抓一把床土，用力一攥，手中的土不成团，部分成了小团，这时土壤含水量约为30%；手中的土成团，手中有微凉的感觉，一米高松开手，自然下落，落地后散开，此时土壤含水量约为50%～60%；手中的土成团，手心有水，一米高自然落下，落地不散，此时土壤含水量高于70%。我们要把土
壤水分控制在50%～60%之间。浇水的时候，看床土的表现，如果土薄，少浇，土厚要分几次浇透。
（4）防病管理
在水稻秧苗两叶期，可以施一些防治病的药物，以避免病害的发生，盐碱土地区要随之调一次酸，调酸要适量，不可过多。
（5）低温管理
在连续阴雨低温天气下，很容易产生卵菌的危害，卵菌产生一般湿度达到70%以上才能发生，所以，少浇水是防止卵菌的重要措施。在低温时，浇水少相对于浇水多的地块，土壤温度显得潮热。
