在宋朝太祖、太宗时期，司农寺仅是“掌供籍田九种，大中小祀供豕及蔬果、明房油，与平粜、利农之事”的单位。直至宋真宗景德三年（1006），“在京东西、河北、河东、陜西、淮南、江南、两浙各置常平仓，以逐州户口多少，量留上供钱一二万贯，小州或三二十贯，付司农寺系帐，三司不问出入”后，司农寺才渐渐扩张其职能。仁宗时，又将广惠仓交付司农寺管理，开始接触稳定各地物价的事宜。
不过司农寺权力的大增，是在宋神宗熙宁三年（1070），原因在于司农寺承接置制三司条例司的工作，成为常平新法的推行机构之后，除负责常平仓、广惠仓、农田水利、免役等工作外，尚须管理各地的提举常平司，对之论功行赏，并遣官巡视诸路。从此一演变来看，其已肩负了领导与监督的责任。此外，司农寺也掌管常平钱、免役钱、坊场钱，俨然成为重要的政务机构。
