百部种子选择成熟度是关键，一定要选择颗粒饱满成熟度高的百部种子育苗。百部种子每年7至8月份成熟，成熟的百部种子果夹会开裂然后将果夹去除将种子保留准备育苗。百部种子分为红花和白花，有的人说红花百部好，其实红花和白花的药用价值其实是一样的不必纠结。
新采摘的百部种子可以直接下地育苗，如果种子是干的可以用清水浸泡48小时在育苗。
百部种子育苗选择地势平坦的沙地，把地土壤打细，开沟打箱。将种子撒播在苗床，然后用营养土覆盖，厚度1公分以下，每亩地用百部种子8斤左右，种子撒播后用水浇透一遍。干旱的地区可以盖上薄膜或者锯末保湿，等到半个月后百部苗会逐渐长出来。
红花种子在4℃以上可发芽,幼苗在-10℃的雪地里仍能生存,幼苗长到6～12cm高时耐-3.9℃低温。红花可抗7.4米/秒大风,开花期可
百部一般采用种子播种育苗然后在进行移栽，百部种子一般7月份成熟，将成熟的百部种子去除果夹将种子晾干即可播种。播种后1个月左右百部苗就会生长出来，但是这种百部苗比较小还不能移栽，要等到生长一年后就可以移栽了。
