华润三九的子公司有:34个,
分别是:昆明华润圣火药业有限公司、澳诺(中国)制药有限公司、深圳华润九新药业有限公司、广东华润顺峰药业有限公司、桂林华润天和药业有限公司、华润圣海健康科技有限公司、三九赛诺菲(深圳)健康产业有限公司、安徽华润金蟾药业股份有限公司、华润堂(深圳)医药连锁有限公司、吉林三九金复康药业有限公司、雅安雨禾药业有限公司、深圳九星印刷包装集团有限公司、辽宁华润本溪三药有限公司、吉林华润和善堂人参有限公司、杭州华润老桐君药业有限公司、合肥华润神鹿药业有限公司、深圳华润三九医药贸易有限公司、北京华润高科天然药物有限公司、华润三九(郴州)制药有限公司、华润现代中药(昆明)有限公司、深圳华润九创医药有限公司、华润三九(南昌)药业有限公司、合肥华润三九医药有限公司、四川三九医药贸易有限公司、本溪国家中成药工程技术研究中心有限公司、深圳华润三九中医药发展有限公司、华润三九(六安)中药材产业发展有限公司、重庆医药集团九隆现代中药有限公司、浙江华润英特中药有限公司、华润三九(黄石)药业有限公司、华润三九药业(香港)有限公司、黑龙江九昌北草堂医药有限公司、三九健康天地有限公司、北京华润北贸医药经营有限公司
