1、低温等异常气候影响
一是低温寡照，水稻抽穗时的适宜温度为25-32℃，若遭遇低温冷害，轻则导致水稻抽穗扬花延迟，灌浆速度减慢，遇极端低温寡照甚至不能抽穗产生包颈、不能开花。二是高温干旱，因“卡脖子旱”造成抽穗困难。
2、施药不当引起
一是施用精噁唑禾草灵等除草剂影响生长，除草剂残留期较长，轻则出现水稻黄叶矮缩，严重会影响抽穗；二是在拔节孕穗期至破口前喷施三唑酮、戊唑醇等药过量，出现包颈现象，唑类杀菌剂会抑制水稻体内赤霉素的形成；三是多种药剂混用，低温寡照诱发了药害。
3、病虫害发生严重
一是稻飞虱传播病毒病，稻飞虱具有突发、蔓延快和隐蔽等特点，若大田防治不利，在水稻孕穗抽穗期发生水稻矮缩病，稻穗不能抽出或抽包颈穗，穗小颗粒少；二是纹枯病严重，水稻纹枯病在孕穗至抽穗期易发病，若发病严重蔓延至穗茎部受害，会引起水稻不能抽穗，抽穗后秕谷较多。
水稻孕穗至抽穗扬花期对环境的抵抗能力差，不仅对唑类药剂敏感，对药剂浓度及喷药时间也十分敏感，用药需掌握好浓度和用药时间，要避开扬花时段用药（上午9点至下午4点）。
水稻出现抽穗困难，可酌情喷施1-2克赤霉素兑水50公斤喷雾，可减轻为害。
水稻孕穗至抽穗期间做好水分管理，若出现高温干旱，要及时抽水灌溉，遇低温可适当建立深水层，以水调温护苗。
防好穗期病虫害，尤其是稻瘟病、纹枯病、稻曲病、稻飞虱、二化螟等，防病用药可选用氟环唑·稻瘟灵、苯甲·吡唑醚菌酯、肟菌酯·戊唑醇等复配制剂，避免太多种药剂混用。
