元胡收获后首先挑选籽种，选无病虫害，直径在1.4-1.6厘米的中等大小的子元胡做种。
选好的籽种要继续放在室内摊薄晾开散发水份，约经10-15天，种皮发白稍干以后可用潮砂以层积法存放。
具体做法是：先在室内铺2-3寸厚潮砂，砂上放4-6寸厚的元胡种，接着上面再铺2-3寸厚潮砂，层层堆放，高度不得超过2-3尺。
堆放以后应经常进行检查，防止鼠害。同时在堆放时，在堆中立放几束稻草，留作气眼，防止发烧。如发现有发烧现象，可用洒壶从堆子顶部均匀洒水。
发现过湿霉烂，要立即翻堆，去掉烂粒，将湿砂内加进干砂掺合，一直存放到下种
