泡沫箱种菜是没有什么毒性的。
但是泡沫这种材质长时间在外面日晒，加上种植土中的一些养分、种菜施肥添加的化学成分，长时间使用很可能会挥发不良的有害物质，有没有毒性还是不确定因素，建议不要长期使用。
冬天的时候，比如北方，要少浇水防止温度太低会结冰冻裂泡沫箱，夏季炎热的时候，比如南方，不要把泡沫箱放在大太阳底下暴晒，要注意适当的给蔬菜遮遮阳，每天早晚的话要注意浇水降温，避免长时间的日晒。
如果泡沫箱不是正规厂家生产，质量达不到国家标准，就会出现另一种可能。劣质的泡沫箱在生产的过程中，原材料会夹杂其他的有机化合物甚至重金属。这种泡沫箱经过暴晒，不但容易老化，其中的有机化合物还会渗透出来进入土壤，影响身体健康。
蔬菜泡沫箱硬度很低，打消水孔的时候，容易把握不好度，打了太大的洞，则以后给蔬菜浇水的时候，很容易导致泥土和水大量渗漏出来，弄脏阳台或是天台。对于这种情况，则可以在消水孔处垫一块滤布再填土。买不到滤布，也可以用破旧的衣服撕一块布来代替。
不过出于谨慎考虑，建议在种菜时最好不要使用废弃的旧泡沫箱种菜。如果泡沫箱以前装过化工用品，箱体本身沾染了有害成分，用这种泡沫箱种菜，是会影响到健康的。
