1、偏施氮肥。植株生长旺盛，叶绿素含量增加，抑制了茄红素的形成，使番茄发生了大量黄斑。或氮肥过多，尤其是土壤中铵离子大量积累，抑制了根系对钾肥的吸收，使营养输送不畅，果实由于缺乏营养而坏死变褐，
2、棚内湿度过大。空气湿度抑制了植株蒸腾作用的进行，使根系吸收水分量急剧降低，导致养分吸收受阻。
3、光照过强或不足。叶面病害严重，整枝打杈过度，植株叶面积小，不能遮住果实，致使番茄果实长时间被阳光直射，过高的温度抑制了果实内茄红素的形成，致使果皮变成黄色。或长期低温寡照，光合强度差，植株对养分的吸收能力弱，影响光合作物的积累。
4、重茬种植。根腐病、枯萎病和生理性死株造成植株慢性死亡，或长期大量施用化肥造成土壤板结，致使营养供应不充足。
5、土壤中缺乏锌、钙、铁、钼和硼等元素，也可造成花脸果。
6、果实呈黄绿、褐黑相间斑点的花脸果，有的也可能是病毒病引起的。
