9%。国家税务部门相关法律法规规定，依据税收法规，玉米和麦子属于农产品，其发票开具的增值税税率为三类，分别为3%、9%、13%，其中一般纳税人收购玉米税率为9%。玉米是禾本科的一年生草本植物，又名苞谷、苞米棒子、玉蜀黍、珍珠米等，原产于中美洲和南美洲。
农产品收购发票开票时税率怎么选
农产品收购发票是指收购单位向农业生产者个人收购自产免税农业产品时,收购方所开具的发票。从农业生产者手中购进农产品，企业可以按收购发票注明的买价计算进项税进行抵扣。一般情况下扣除率是9%，如果购进的农产品用于生产13%税率的货物的，在领用当期加计扣除10%的进项税，也就是实际扣除率为10%。其相关的计算公式如下：进项税额＝买价×扣除率
法律依据
《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条 第八条 纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产支付或者负担的增值税额，为进项税额。
下列进项税额准予从销项税额中抵扣：
（一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。
（二）从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额。
（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算的进项税额，国务院另有规定的除外。进项税额计算公式：
进项税额=买价×扣除率
（四）自境外单位或者个人购进劳务、服务、无形资产或者境内的不动产，从税务机关或者扣缴义务人取得的代扣代缴税款的完税凭证上注明的增值税额。
准予抵扣的项目和扣除率的调整，由国务院决定。?
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农产品收购发票开票时税率选免税。
(一)
收购发票填开
操作步骤：
第一步点击“发票管理/发票填开/收购发票填开”菜单项，在弹出“发票号码确认”提示框中点击“确认”按钮，
第二步填写发票票面信息。其中货物或应税劳务服务名称、销售方名称信息既可以从编码库中取数据，也可以在发票填开界面直接手工填写，其他信息需由手工进行填写，
第三步打印发票：当发票填写完毕且检查无误时，点击工具条上的“打印”按钮即可，则系统首先将所开发票信息记入金税盘与开票软件数据库，随后便弹出“发票打印”对话框，如图5-67所示。在此处，可以设置纸张打印边距、预览打印效果、实施打印，也可以取消打印（待以后在进行发票查询时打印）。
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说明：
①如果企业在税务端发行时授权为汉字防伪企业，则企业开具出的收购发票密文为二维码；如果企业是非汉字防伪企业，则开具出的收购发票密文为108位。
②收购发票所用的纸质发票为“增值税普通发票”，在发票左上以“收购”二字作为标识作以区分。
③收购票的购方信息在票面上方，销售方信息在票面下方，与普通发票是相反的，填开时请注意区分。
