农产品收购发票是指收购单位向农业生产者个人收购自产免税农业产品时,收购方所开具的发票。从农业生产者手中购进农产品，企业可以按收购发票注明的买价计算进项税进行抵扣。一般情况下扣除率是9%，如果购进的农产品用于生产13%税率的货物的，在领用当期加计扣除10%的进项税，也就是实际扣除率为10%。其相关的计算公式如下：进项税额＝买价×扣除率
法律依据
《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条 第八条 纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产支付或者负担的增值税额，为进项税额。
下列进项税额准予从销项税额中抵扣：
（一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。
（二）从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额。
（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算的进项税额，国务院另有规定的除外。进项税额计算公式：
进项税额=买价×扣除率
（四）自境外单位或者个人购进劳务、服务、无形资产或者境内的不动产，从税务机关或者扣缴义务人取得的代扣代缴税款的完税凭证上注明的增值税额。
准予抵扣的项目和扣除率的调整，由国务院决定。?
请点击输入描述（最多18字）
农产品进项税如何进行抵扣处理
针对不同的购进主体，一般纳税人购进农产品可抵扣进项税额计算如下：
一、购入农业生产者销售的免税农产品，取得或开具收购发票，一般情况计算抵扣9%（发票买价×9%），深加工13%产品计算抵扣10%（发票买价×10%）。
例1：从果农处购入其自产的水果一批（免税农产品），取得收购发票注明买价 10000 元。
（1）如直接销售，抵扣进项税＝10000×9%＝900元，该批水果成本=10000-900=9100元；
（2）如进一步加工13%的产品，抵扣进项税＝10000×10%＝1000元，该批水果成本=10000-1000=9000元。
二、取得一般纳税人开具9%专票或海关9%进口缴款书，一般情况凭票抵扣9% ，深加工13%产品计算抵扣10%。
例2：从水果经销商（一般纳税人）处购入水果一批，取得增值税专用发票注明价款 10000 元，增值税 900 元。
（1）如直接销售，抵扣进项税＝10000×9%＝900元，就是票面注明的税额 ；该批水果成本=票面的不含税金额10000元；
（2）如进一步加工13%的产品，抵扣进项税＝10000×10%＝1000元 ，该批水果成本=价税合计金额10900-进项税额1000=9900元。
三、取得简易计税小规模纳税人开具3%专票计算抵扣9%（发票不含税金额×9%），深加工13%产品计算抵扣10%。
例3：从水果经销商（小规模纳税人）处购入水果一批，取得增值税专用发票注明价款 10000 元，增值税 300 元。
（1）如直接销售，抵扣进项税＝10000×9%＝900元 ，该批水果成本=价税合计金额10300-进项税额900=9400元；
（2）如一步加工13%的产品，抵扣进项税＝10000×10%＝1000元，该批水果成本=价税合计金额10300-进项税额1000=9300元；
（3）如取得的是增值税普通发票，则不允许抵扣进项税，该批水果成本=价税合计金额10300元。
四、从批发零售环节购进免税蔬菜、部分鲜活肉蛋取得普通发票不得抵扣进项。（因为本身免税了，只能开普票，进项自然也不能抵扣）。
法律依据
《增值税暂行条例》第八条规定，纳税人购进货物或者接受应税劳务（以下简称购进货物或者应税劳务）支付或者负担的增值税额，为进项税额。
下列进项税额准予从销项税额中抵扣：
（一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。
（二）从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额。
（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额。进项税额计算公式：
进项税额＝买价×扣除率
（四）购进或者销售货物以及在生产经营过程中支付运输费用的，按照运输费用结算单据上注明的运输费用金额和7%的扣除率计算的进项税额。进项税额计算公式：
进项税额＝运输费用金额×扣除率
准予抵扣的项目和扣除率的调整，由国务院决定。
《财政部、国家税务总局关于农民专业合作社有关税收政策的通知》（财税（2008）第081号）规定，增值税一般纳税人从农民专业合作社购进的免税农业产品，可按13%的扣除率计算抵扣增值税进项税额。
农产品进项税抵扣处理：
一、从一般纳税人处取得专用发票。购进农产品，取得一般纳税人开具的增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书，直接按票上的进项税额抵扣，不需要计算应抵扣的进项税。
二、从小规模纳税人处取得专用发票。根据规定，购进农产品，从按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额。用于生产13%税率的，按照10%扣除率计算进项税额。
三、向农业生产者个人购进的自产农产品，可以凭自行开据的农副产品收购发票计算抵扣进项税。农产品收购发票是指收购单位向农业生产者个人(不包括从事农产品收购的个体经营者)收购自产农业免税产品时，由付款方向收款方开具的发票。农户销售自产农产品免征增值税，企业在开具收购发票的时候也是免税开具。
四、农产品生产单位销售自产农产品或向农民专业合作社销售的农产品以及采取“公司+农户”经营模式销售的农产品，都是免征增值税，可以开具免税的农副产品销售发票。作为购买方虽然索取的是免税的增值税普通发票，但仍然可以根据发票金额计算抵扣增值税。可以抵扣的进项税额=票面金额×9%，用于生产13%税率深加工产品按照10%扣除率计算进项税额。
