目前，养殖用苗主要为中华鳖苗、台湾鳖苗、泰国鳖苗、杂交苗等。实践证明，中华鳖苗抗病力强、病害少、适应性强，具有较强的生长优势。因此，养殖甲鱼应首选中华鳖苗。健康苗种的特征是体肥、体型宽大、体表光洁、无伤残、活动力强。苗种应就近采购，这样才容易适应当地养殖。
甲鱼放养前应进行体表消毒处理：（1）用2.5%的食盐浸泡8～15分钟可杀死体表寄生虫。（2）用1%的食盐混合小苏打（1∶1）的溶液浸泡20～30分钟可预防水霉病。（3）用20～30微克的呋喃唑酮混合15～20微克的红霉素浸泡20～30分钟可预防细菌性疾病和减少甲鱼对环境的应激反应。
