1、缴费标准不同
城镇职工医疗保险缴费是由用人单位和职工共同承担的，按照规定的缴费基数和比例来缴的，每个月的工资账单一看里都有这么一笔钱用来缴医保了。
职工医保的缴费都是按月缴的，不同地方缴费差异比较大，交的钱也不一样。
新农村合作医疗也是按年缴的，由个人、集体和政府多方筹资，因为国家对不同地区的医保补贴力度不一样，所以新农合也有很强的地域性。
2、使用范围不同
新农合使用范围：新农合目前只有住院才能报销，少部分城市看病就诊也能报销。
社保使用范围：社保中的医疗保险缴费，可以用于挂号、看病就医、药店买药、住院治疗报销等。
3、参保范围不同
新农合：只有农村户口才可以办。
社保：只要有正式的工作或在城镇都可以参加社保。
社保的报销比例较高，报销比例一般为70~80%；而新农合的报销比例相对较低，一般为50~70%，尤其是异地报销的时候，报销比例可能只有30~40%。
但是在起付线上，城乡居民医保的要更低一些。也就是说，城镇职工医保难报，但报的多；而城乡居民医保容易报，也报的少。
4、参保年限不同
一般情况下，社保当中的养老保险需要连续缴纳满15年；医疗保险男性参保年限为25年，女性为20年；失业保险缴费满1年以上，才能享受保险待遇。
新农合是一年交一次费用，就目前来说，国家没有设定新农合的参保年限，也就是说交了就能享受报销待遇，不交就享受不到。
