1、股份区别:农商银行属地区银行,大股东一般为地区国资办,地区不一样,大股东不一样,并不是统一的大股东。农业银行是全国性银行,大股东为国家国有资本的汇金公司,全国各地营业网点均为支系机构;
2、法人区别:农商银行是地区银行,地区不一样,法人不同,全国各地的农商银行均为单独法人;而农业银行是一级法人,法人只有一个,支系机构均为责任人;
3、经营规模区别:农商银行是地区银行,经营规模小,农业银行是全国性银行,经营规模大,农商银行资产经营规模远不如农业银行,农业银行是国家银行,实力雄厚,资产整体实力强。