畜禽养殖业已成为农业污染源的主要来源。据测算，目前我国畜禽粪便产生量已经近40亿吨，而综合利用率不足50%。畜禽养殖的COD和氨氮排放量分别占到农业源排放总量的96%和44%左右。
针对养殖污染问题，国家相关文件提出，到2020年，规模化养殖场、养殖小区配套建设废弃物处理设施比例应达到75%以上。
要引导畜禽标准化规模养殖，以生态养殖促进转型增效。为此，要建立现代畜禽种业，提高畜牧生产的现代化水平；推进资源循环利用，提高畜禽生产的生态化水平；加快构建现代畜牧产业体系，提高产业发展的绿色化水平；推进供给侧结构性改革，促进全产业链一体化发展，努力提高畜禽生产的经济、生态效益。
