云南烤烟制种下雨天采收的种子这么处理：
1、迅速晾干：将收获的烟草种子迅速摊开晾干，尽量避免阳光直射，以免种子受到热损伤。
2、适当加热：在湿度较高的环境中，可以使用烘干设备或者取暖器等设备，对种子进行适当加热处理，以降低种子表面的水分。
3、及时翻动：在晾干过程中，要定期翻动种子，以确保种子均匀干燥，避免受潮部分发霉。
4、筛选优质种子：在晾干后，要仔细检查种子，挑选出表面光滑、饱满、无病虫害的优质种子，剔除受潮或破损的种子。
5、储存条件：将筛选出的优质种子存放在干燥、通风、避光的环境中，如密封的塑料袋或玻璃瓶等容器内。
6、种子处理：在播种前，可以对种子进行消毒和浸泡处理，以减少病虫害的发生。
