没有办理房产证的商铺在实质上还是属于开发商，如果受到欺诈的情况下，购房者可能房钱两空。
1.不利于不动产的继承、赠与：商铺的变动，在法律上是严格的登记公示主义，没有房产证的商铺会导致继承合同、赠与合同的无效。
2.不利于夫妻共同财产的分割：夫妻在离婚时，涉及到夫妻财产的分割，而对商铺的分割尤其重要，没有房产证的商铺同样也是无法进行分割的。
3.不利于商铺转让：购房者购房往往有保值的目的，在市场价格发生变动的时候，购房者会考虑对商铺进行变现。但房产的交易是需要商铺权属证明的。没有房产证的商铺在交易中，是不受法律保护的。
4.不利于进行抵押：银行办理抵押需要对房产证进行审核，没有房产证是无法办理抵押贷款的。
5.不利于出租：如果承租人以出租人没有房产证不是该商铺的合法人为由不交租的话，法律上是支持这种观点的。
商铺产权40年后怎么办
在正常情况下，房屋年限有40年、50年和70年三种分类，70年的主要是指普通住宅，50年的指工业用地，40年的主要是指商业用地。房屋产权其实不仅仅包括房屋的产权，还有房屋所在土地的使用权。购房者对房屋的使用权是永久性的，而这所谓的40年的产权限制主要指的是土地使用权。我国土地属于国家，房主只是租用人。根据《物权法》规定，住宅建设用地使用权期限届满的，自动续期，非住宅建设用地使用权期限届满后的续期，依照法律规定办理。
在房屋40年产权到期后，一般有以下两种情况：
①延长土地使用权期限。这种情况的话可以由房屋业主联名来向当地的国土资源局提出申请，补交土地出让金，当然这个价格应该低于同类的土地出让金的价格，类似于成本价和市场价的差额。
②如果是根据规划需要，国家需要收回土地和地上建筑物的。那么业主也可以得到相应的经济补偿，用类似拆迁安置的办法解决。
法律依据：《中华人民共和国物权法》第一百四十九条建设用地使用权续期及土地上的房屋及其他不动产归属住宅建设用地使用权期间届满的，自动续期。非住宅建设用地使用权期间届满后的续期，依照法律规定办理。该土地上的房屋及其他不动产的归属，有约定的，按照约定;没有约定或者约定不明确的，依照法律、行政法规的规定办理。
