主要区别有，形态特征不同、生活习性不同、食用价值不同，具体如下：
一、外形特征不同
1、山老鼠
山鼠，又名山地鼠，身体肥壮，毛色背部棕褐色，毛基灰白色，毛尖棕**，头及背部杂有栗黑色的毛。腹面灰白色。尾毛两色，上面黑褐色，下面灰白色。
2、老鼠
老鼠，俗称“耗子”，体型较小，体色以灰、褐色为主。
二、生活习性不同
1、山老鼠
生活在海拨1000米左右丛林中，主要以香菇，笋，地瓜等为主食，性情凶猛，且贪婪。为了活命，山鼠每日必须四处活动，寻找可以充饥的食物，又因为担心被蛇、鹰等天敌吞食，山鼠们总是小心翼翼，战战惊惊，一有风吹草动，立即魂飞魄丧地四处分散，逃回洞穴。2、老鼠
老鼠常出没于下水道、厕所、厨房等带菌场所与干净场所来回行动，经由鼠脚、体毛及胃携带物来传播病原菌。老鼠白天藏匿，夜间出来活动，来无影去无踪，从来不与人打照面。食性很杂，爱吃的东西很多，几乎人们吃的东西它都吃，酸、甜、苦、辣全不怕，但最爱吃的是谷物类、瓜子、花生和油炸食品。
三、食用价值不同
1、山老鼠
山鼠肉味道鲜美，是上等的营养补品。江西，福建等地素来就有吃"山老鼠腊"的传统。
2、老鼠
老鼠是很多疾病的贮存宿主或媒介，对人类有传播疾病的鼠疫，不但不能食用，而且对人类有害。
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