一、成立时间不同
1、清华计算机系实验班：清华大学计算机科学与技术系成立于1958年。
2、清华计算机系：清华大学计算机科学实验班由姚期智先生主导，创办于2005年。
二、课程设置不同
1、清华计算机系实验班：姚先生融合美国麻省理工、斯坦福和普林斯顿大学的计算机教育的先进方法，专门为姚班精心准备了15门核心课程。
2、清华计算机系：计算机系设有计算机科学与技术与软件工程两个一级学科。其中计算机科学与技术学科属全国首批国家重点一级学科。
该一级学科下包含有计算机系统结构、计算机软件与理论、计算机应用技术三个二级学科，这三个二级学科同样全部为全国重点二级学科，是全国少数拥有全部重点二级学科单位之一。
三、发展方向不同
1、清华计算机系实验班：，42人在姚先生创建的清华大学交叉信息研究院读博，25人在清华计算机系继续深造。
85人赴美国、新加坡、香港和法国等地读研，其中有赴MIT 5人、Princeton 9人、斯坦福大学5人、CMU 6人、耶鲁大学1人、宾夕法尼亚大学3人、哥伦比亚大学6人、UCBerkeley2人等；20人赴MSRA、IBM、Facebook、网易等著名计算机企业工作。
2、清华计算机系：计算机系与政府、众多企业、高校联合成立了多个研究中心，包括普适计算（教育部）重点实验室、媒体与网络技术教育部-微软重点实验室、可视化媒体智能处理与内容安全北京市高等学校工程研究中心。
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清华计算机系认可共同一作吗
清华大学最牛的三个系为：经济管理学院、建筑学院、计算机科学与技术系。
一、经济管理学院：
清华大学经济管理学院（英文名：School of Economics and Management，Tsinghua University）简称清华经管学院，位于北京市海淀区双清路30号，为清华大学下属二级学院。
清华经管学院是中国内地率先获得AACSB和EQUIS两大全球管理教育顶级认证的商学院，2015年清华-INSEAD EMBA双学位项目在英国《金融时报》EMBA排名中位列全球第一。
清华经济管理学院成立于1926年，最初命名为“清华经济学系”，后因中国高等学校院系调整，曾并入北京大学。1979年改名“经济管理工程系”，后于1984年正式改为“经济管理学院”。
清华经济管理学院共有学位项目学生5977人，教师158名。学院下设7个专业系所，4个博士后流动站，2个博士、硕士学位授予权的一级学科。
二、建筑学院：
清华大学建筑学院作为清华大学设置的19个学院之一，其前身清华大学建筑系由著名建筑学家梁思成先生于1946年10月创办，后于1988年成立学院。建筑学院下设建筑系、城市规划系、景观学系、建筑技术科学系。
此外，跨院系成立的校级科研机构清华大学建筑与城市研究所、清华大学人居环境研究中心和清华大学建筑节能研究中心也依托建设于建筑学院。
三、计算机科学与技术系：
清华大学计算机科学与技术系（以下简称计算机系）成立于1958年。1996年，计算机系在由国务院学位办公室主持的全国计算机学科评估中排名第一，在国内首批获得按一级学科招收和培养研究生的资格。
2006年、2012年在全国学位与研究生教育发展中心开展的一级学科整体水平评估中，以总分满分100分的成绩排名第一；2017年，计算机科学与技术学科在全国一级学科评估中，获得A+。
认可。2021年12月清华计算机系学生荣获清华特奖和先进班集体，以第三作者和共同一作身份在国际会议上发表高水平论文，认可共同一作。清华大学位于北京市海淀区清华园，是由中华人民共和国教育部直属的高校。
