目前教育部门并没有发布权威的大学排行榜单，本文为大家整理的是第三方评价机构（校友会）2023年、2024年发布的新疆自治区大学排行榜，供大家选择学校时参考，当然我们不能认为这就是最权威的排名，大家还需要结合其他各方面因素来综合考虑。
| 序号 | 全国排名 | 学校名称 | 城市 |
| 1 | 174 | 新疆大学 | 乌鲁木齐 |
| 2 | 221 | 石河子大学 | 石河子 |
| 3 | 227* | 新疆医科大学 | 乌鲁木齐 |
| 4 | 236 | 新疆农业大学 | 乌鲁木齐 |
| 5 | 249* | 新疆师范大学 | 乌鲁木齐 |
| 6 | 306 | 塔里木大学 | 阿拉尔 |
| 7 | 328 | 新疆财经大学 | 乌鲁木齐 |
| 8 | 351* | 伊犁师范大学 | 伊犁 |
| 9 | 407 | 喀什大学 | 喀什 |
| 10 | 436* | 昌吉学院 | 昌吉 |
| 11 | 453 | 新疆工程学院 | 乌鲁木齐 |
| 12 | 472* | 新疆艺术学院 | 乌鲁木齐 |
| 13 | 501* | 新疆警察学院 | 乌鲁木齐 |
| 14 | 510 | 新疆科技学院 | 巴音郭楞 |
| 15 | 510 | 新疆理工学院 | 阿克苏 |
| 16 | 518* | 新疆政法学院 | 图木舒克 |
| 17 | 531* | 新疆第二医学院 | 克拉玛依 |
| 序号 | 全国排名 | 学校名称 | 城市 |
| 1 | 138 | 新疆大学 | 乌鲁木齐 |
| 2 | 159* | 新疆医科大学 | 乌鲁木齐 |
| 3 | 186 | 石河子大学 | 石河子 |
| 4 | 189 | 新疆农业大学 | 乌鲁木齐 |
| 5 | 193* | 新疆师范大学 | 乌鲁木齐 |
| 6 | 249 | 塔里木大学 | 阿拉尔 |
| 7 | 294 | 新疆财经大学 | 乌鲁木齐 |
| 8 | 351* | 伊犁师范大学 | 伊犁 |
| 9 | 380 | 喀什大学 | 喀什 |
| 10 | 402 | 新疆工程学院 | 乌鲁木齐 |
| 11 | 434* | 昌吉学院 | 昌吉 |
| 12 | 483* | 新疆艺术学院 | 乌鲁木齐 |
| 13 | 505* | 新疆警察学院 | 乌鲁木齐 |
| 14 | 511 | 新疆科技学院 | 巴音郭楞 |
| 15 | 516 | 新疆理工学院 | 阿克苏 |
| 16 | 516* | 新疆政法学院 | 图木舒克 |
| 17 | 528* | 新疆第二医学院 | 克拉玛依 |
