南京审计大学金审学院和浙江万里学院在院校历史、专业设置等各有优势。如果您倾向于审计、会计、金融等专业，并希望在有着20多年历史的学校里接受专业的审计教育，可以选择南京审计大学金审学院的审计、会计或金融专业。如果您更倾向于有一种更广泛的专业选择，并希望在一个国有改制高校中接受教育，可以选择浙江万里学院的54个招生专业中的任一专业。详细对比如下：
1.院校历史：南京审计大学金审学院在2002年由南京审计学院设立，2005年转制为独立学院，2015年更名为南京审计大学金审学院，总体来看，其发展历程较短，但专注于审计、会计和金融领域。浙江万里学院是中国第一所国有改制高校，实行民办学校运行机制，代表了中国高等教育的一种新型管理模式和运行机制，具有一定的历史影响力。
2.地理位置：南京审计大学金审学院位于江苏省南京市，这是一个充满历史文化和现代化设施的城市，为学生的学习和生活提供了丰富的可能性。而浙江万里学院位于浙江省宁波市，这也是一个充满活力的经济发达城市，为学生提供了广阔的就业和发展机会。
3.特色专业：南京审计大学金审学院主要以培养审计、会计、金融人才为主，专业特色鲜明。而浙江万里学院提供了54个招生专业，覆盖了理、工、文、经、法、教育、艺术等多个学科领域，专业选择更为丰富。
4.优势学科：南京审计大学金审学院的审计、会计、金融专业具有一定优势，是其主要的专业方向。而浙江万里学院作为国有改制高校，其优势学科可能会更加多元化，有更多的选择空间。
5.科研实力：根据提供的信息，两所学校都未提及具体的科研实力和科研项目。但浙江万里学院作为硕士学位授予单位和多个教育联盟的理事单位，其科研实力可能相对较强。
