盐水鸭作为南京的特色美食，民间流传有不少关于咸水鸭的由来小故事，比如：
1、元朝末年，朱元璋打算在江苏安徽一带起义，计划在中秋节起事，规定联络暗号为“驱元兵，杀鞑子”，谁料走漏了消息，元朝统治者调兵遣将，占领了各地要道，到处搜查。元兵先从江南统治者的核心地区南京搜起，而南京老百姓为了保护起义军秘密，便合谋把“驱元兵，杀鞑子”改为“吃月饼，杀鸭子”。元兵来查，老百姓们都不约而同地说：“这是咱们南京人过八月节的习惯，每家每户回都要做月饼、杀鸭子。”元兵答们听了，疑团顿解，知道是听错了，撤回了兵。就这样南京老百姓面临的一场危机，终于安然度过了。后来朱元璋在南京做了皇帝，感谢老百姓的掩护，便规定中秋节，每家每户不仅要吃月饼，还要吃鸭子，以纪念此事。
2、还有一种说法是盐水鸭与乾隆有关，乾隆下江南点名要吃一家餐厅的烤鸭，厨师连忙进了批鸭子，下午回来时却发现，鸭子全部死掉了，原来是养鸭人的孩子用盐巴来逗鸭子，导致鸭子被活活咸死，鸭子的盐分太高，烤的时候会炸开，可是乾隆马上就要来了，再去找一批鸭子也来不及了，厨师硬着头皮把那几只鸭子给煮了，乾隆吃了表示“深得朕意”并御赐其名盐水鸭。
