离婚时，有两个孩子的夫妻可以选择以下两种主要方式：
协议离婚
双方需签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应包含双方自愿离婚的意愿、对子女抚养、财产分割及债务处理等事项的共识。
准备材料包括：身份证、结婚证、户口簿、离婚协议书等。
诉讼离婚
如果一方不同意离婚或双方无法就离婚事宜达成一致，可以向人民法院提起离婚诉讼。
准备材料包括：身份证、结婚证、起诉状、可能的证据材料等。
法院在审理离婚案件时，会进行调解，如果感情确已破裂且调解无效，法院将准予离婚。
在离婚过程中，孩子的抚养权是一个重要考虑因素，通常情况下，法院会根据孩子的最佳利益来决定抚养权的归属，并可能考虑双方的经济能力、抚养条件、孩子的意愿等因素。
请根据您的具体情况选择合适的离婚方式，并咨询专业律师以获得更详细的指导
