公司回购股份后的处理方式主要有以下几种：
注销股份
公司购回本公司股票后，可以选择将这部分股份注销。
注销股份必须在十个工作日内完成，并向工商行政管理部门申请办理注册资本的变更手续。
作为库存股保留
如果公司选择将回购的股份作为库存股保留，则必须在十个工作日内完成登记手续。
库存股作为所有者权益的抵减项，列示在所有者权益项目中，不体现股利分配和表决权，也没有资产清算权利。
特定情形下的处理
若公司因减少公司注册资本而回购股份，则应当自收购之日起十日内注销。
若公司因与持有本公司股份的其他公司合并或股东因对股东大会作出的公司合并、分立决议持异议而要求公司收购其股份，则应在六个月内转让或注销。
若公司因将股份用于员工持股计划或股权激励而回购股份，则应在一年内转让给职工。
会计处理
回购股份用于减少公司注册资本时，会计分录包括：
回购股份时：借：库存股 贷：银行存款
股份注销时：借：股本 资本公积—股本溢价 盈余公积 利润分配—未分配利润 贷：库存股
根据以上规定，公司回购股份后可以根据实际情况选择注销或保留为库存股，并且在不同情形下有不同的处理时间和程序要求。
